ФК ЦСКА 1948 е основан на 19 юли 2016 г. след фалита на автентичния ЦСКА. Част от привържениците на “червените”, водени от хазартния бос – Цветомир Найденов, създават нов тим, който започва от аматьорските дивизии.

Първият официален двубой на ЦСКА 1948 се провежда през септември 2016 г., когато бива победен Люлин (София) с гръмкото 8:0. Новакът в софийската областна група се представя на високо ниво през сезона и заслужено печели златните медали. Следва един сезон в Трета лига, в който “червените” така и не допускат поражение (29 победи и 5 ремита).

ФК ЦСКА 1948 прекарва два сезона във втория ешелон. През 2018/2019 финишира на 4-а позиция, а следващата година заема временното 1-во място, когато кампанията бива прекъсната. Това води до промоция във висшата дивизия на България.

Благодарение на силната си селекция отборът се утвърждава в елита и още в първата си кампания намира място в топ 6.

Първоначално ЦСКА 1948 играе домакинските си мачове на ст. “Васил Левски”, а след това се премества на терените в кв. “Обеля”, с. Герман и кв. “Драгалевци”. При първата си поява в професионалния футбол клубът се връща на националния стадион. Към днешна дата (2022/2023) ЦСКА 1948 приема своите опоненти на стадиона в Бистрица.

Основните цветове на тима са червено и бяло. За някои гостувания се използват черни фланелки с черни гащета.

Преди началото на сезон 2022/2023 ръководството на ЦСКА 1948 обяви Любослав Пенев за старши треньор.